สกพอ. มีเป้าหมายในการยกระดับโครงสร้างพื้นฐานทางด้านการคมนาคมในพื้นที่สามจังหวัด
ได้แก่ ฉะเชิงเทรา ชลบุรี และระยอง รวมทั้งพื้นที่ข้างเคียงให้มีความเชื่อมโยงกันอย่างไร้รอยต่อทุกระบบ ทั้งทางบก น้ำ อากาศ
เพื่อให้ประชาชนมีทางเลือกในการเดินทางมากขึ้น และพร้อมสู่การเป็น "World-Class Economic Zone"
รองรับการลงทุนอุตสาหกรรมเป้าหมายของประเทศ โดยมีโครงการขนาดใหญ่ที่สำคัญเป็นพิเศษ (Flagship Project) ดังนี้